Prototype
New York, Manhattan Yarımadası (çok detaylı), günümüz. Kasaba halkı, insanları kana susamış canavarlara dönüştüren bir mutasyonla karşılaşır.
Oyunun kahramanı, görünüşte dikkat çekici olmayan Alex Mercer adında bir genç adamdır. Oyunun başında onun hakkında çok az şey biliyoruz ama yine de kendisi hakkında bildiğinden daha fazlası var; Alex hiçbir şey hatırlamıyor, süper yeteneklere sahip olduğunu bile bilmiyor.
Yetenekler onun için çok faydalı çünkü salgını durdurması ve aynı zamanda ordudan, polisten ve paralı askerlerden saklanması gerekecek.
### Konu
Alex, Ghentec'in Manhattan'daki genel merkezinde bulunan morgunda aklını başına toplar. Görünüşe göre uyanmasının nedeni, Blackwatch örgütünün paralı askerlerinin bu karargahın kapılarını kırmaya çalışırken çıkardığı gürültüydü.
Alex saklanmaya, kaçmaya çalışır. Paralı askerler onu durdurmaya çalışır, ancak Alex kendi içinde birer birer inanılmaz yetenekler keşfeder - kurşunlardan zarar görmez, yükseğe zıplayabilir, ağır nesneler fırlatabilir, binaların duvarlarında koşabilir. Ve insanları "özümseyebilir", görünüşlerini alabilir ve özümsemiş insanların bildiği ve hatırladığı her şey hakkında bilgi edinebilir. Örneğin Blackwatch komutanlarından birinin görevi devralmasının ardından Alex, bir kız kardeşi olduğunu öğrenir.
Alex kız kardeşini bulur ve ondan oyunun başında onunla tanıştığımız şirketin önemli bir çalışanı olduğunu (bu sefer kendini kaptırmadan) öğrenir. Alex'in iş görevleri arasında biyolojik silahlarla çalışmak da vardı.
Oyun sırasında ordu ve polis, Alex'i virüsü yaratmak ve yaymaktan suçlu buluyor, Blackwatch başka nedenlerle Alex'in peşine düşüyor ve Alex de süper yeteneklerinin tüm gücüyle mutantları ve diğer rakipleri durdurmaya çalışıyor. Çok geçmeden bu süper güçler arasında vücudunu silahlar, kalkan ve zırh da dahil olmak üzere neredeyse her şeye dönüştürme yeteneğinin olduğu ortaya çıkıyor.
###Oyun
Oyunun en başından itibaren Manhattan'ın tamamı oyuna açıktır. Ancak Manhattan'ın dışına çıkamazsınız. Oyuncu hikayeyi takip edebilir ve ayrı görevler gerçekleştirebilir. Süper yeteneklerin varlığı nedeniyle kahraman hem yatay olarak hem de duvarlarda hareket edebilir. Ama bir böcek olarak değil, sadece koşuyor. Yüksekten düşmek Alex'e zarar vermez, bu yüzden bu numarayı rakiplerini yenmek için kullanabilir - kelimenin tam anlamıyla kafalarının üzerine düşebilir.
Alex çok yükseğe zıplayabilir ve havada plan yapmayı başarabilir.
Alex, vücudunun dönüşme yeteneğini kullanarak savaşır. Elleri balyozlara, bıçağa, kırbaçlara veya kalkanlara dönüşebilir. Güçlerini artırmak için vücudunun kaslarının hacmini anında artırabilir - normal modda böyle bir kütle onu engellerdi, bu yüzden tüm bu kasları her zaman takmıyor. Derisi zırha dönüştürülebilir. Ayrıca karanlıkta görebilir ve mutantları normal insanlardan gözleriyle ayırt edebilir.
Oyunda ilerledikçe ve çeşitli görevleri yerine getirdikçe tüm yetenekler de geliştirilebilir.
Kahraman, vücudun süper güçlerinin yanı sıra saldırı tüfekleri, makineli tüfekler, el bombası fırlatıcıları, roketatarlar kullanır, piyade savaş araçlarını, tankları, helikopterleri ele geçirir ve silahlarını kullanır.
